Opiekę medyczną w mieście zapewniają 3 przychodnie (ul. Krótka, ul. Daszyńskiego, ul. Sikorskiego) oraz spółki lekarskie.
Usługi lekarskie świadczone są przez lekarzy rodzinnych, pediatrów, chirurgów, stomatologów, ginekologów. Wielu kętrzyńskich lekarzy posiada prywatne praktyki. W mieście znajdują się gabinety różnych specjalności: chorób wewnętrznych, pediatryczne, laryngologiczne, ortopedyczny, neurologiczny, medycyny pracy. Część gabinetów ma podpisane umowy z Regionalną i Branżową Kasą Chorych na refundację recept. Na terenie miasta znajduję się również szpital miejski dysponujący 196 łóżkami.